Les maladies infectieuses : une menace majeure pour les amphibiens

Contexte

Bien que moins connu que la destruction, la fragmentation et la pollution des habitats, la surexploitation, l’introduction d’espèces exotiques et le changement climatique, les maladies infectieuses figurent parmi les principales causes du déclin mondial des amphibiens. La Bourgogne-Franche-Comté n’est pas épargnée ; la présence de Ranavirus, responsable de la ranavirose, est connue dans le département du Jura. La présence d’herpes-virus, responsable de l’herpesvirose, et du pathogène fongique Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), responsable de la chytridiomycose, ont également été démontrées dans le département du Doubs. La présence du second champignon responsable de la chytridiomycose, Batrachochytrium salamandrivorans (Bsal), n’a pas encore été démontrée en France.

La chytridiomycose est aujourd’hui reconnue comme une menace majeure pour les populations d’amphibiens avec des cas de mortalités massives ou de disparitions d’espèces documentées à travers le monde. Pour ne donner qu'un chiffre, aux Pays-Bas, 96 % des populations de salamandre tachetée (Salamandra salamandra) ont été décimés par la chytridiomycose via Bsal entre 2010 et 2013.

Salamandre tachetée (Salamandra salamandra) infectée par la pathogène fongique Bsal

© F. Pasmans

Par l'ensemble de nos activités en zones humides, nous sommes toutes et tous desvecteurs potentiels des agents pathogènes des amphibiens. Comparativement aux « vecteurs naturels » (amphibiens, oiseaux d’eau, etc.) nous pouvons disperser les agents pathogènes sur de bien plus longues distances (commerce international d’animaux vivants, déplacements consécutifs à des chantiers en zones humides, etc.) et en grandes quantités (déplacements de matériaux d’extraction à partir des masses d’eau).

Afin d’en savoir plus sur les maladies pouvant affecter les amphibiens (et les reptiles) sur le territoire régional, un extrait de notre cycle de conférence réalisé en 2023 est disponible ICI.

Concrètement, que pouvons-nous faire ?

La surveillance et la remontée d’informations sont les premières mesures de prévention à appliquer. Pour cela, nous vous invitons à faire remonter vos observations suspectes au réseau SAGIR (Réseau national responsable de la veille et la lutte contre les agents infectieux de la faune sauvage) à sagir@ofb.gouv.fr ET à les inscrire sur les bases de données naturalistes avec le mot-clé « maladie ». Afin que votre signalement soit le plus qualitatif possible, merci d’y joindre, dans la mesure du possible, des photos, commentaires ainsi qu’une localisation précise.

S’en suit le déploiement de mesures simples de nettoyage voire de désinfection de l'ensemble de son matériel de travail ou de balade. Le détail des gestes et reflexes simples à avoir est détaillé dans notre protocole de biosécurité disponible ICI. Ce document sera régulièrement mis à jour en fonction des avancées scientifiques et réglementaires.

Le réseau SAGIR a également mis à disposition un protocole dédié à l’intervention en zones humides. Ce dernier est disponible ICI.

Pour toute demande de compléments ou remontées d’informations liées à la problématique des maladies infectieuses de l’herpétofaune, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse suivante : franche-comte@lpo.fr